您當(dāng)前的位置:首頁未來正文

最新:我國科學(xué)家研究解析蘋果轉(zhuǎn)座子插入調(diào)控等位基因特異性表達(dá)

2022-08-18 19:33:44 科技日?qǐng)?bào)


(相關(guān)資料圖)

科技日?qǐng)?bào)記者 馬愛平 通訊員 何文上

近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所蘋果資源與育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國內(nèi)外科研機(jī)構(gòu),從全基因組層面上闡釋了蘋果轉(zhuǎn)座子(TE)在調(diào)控等位基因特異性表達(dá)(ASE)方面的重要作用。相關(guān)研究成果發(fā)表于《植物生物技術(shù)雜志》(Plant Biotechnology Journal)。

轉(zhuǎn)座子引發(fā)的遺傳變異會(huì)導(dǎo)致物種表型多樣性與生物進(jìn)化,在蘋果基因組中,轉(zhuǎn)座子的比例高達(dá)近60%。蘋果由于自交不親和導(dǎo)致其基因組高度雜合,個(gè)體中存在大量的等位基因,但轉(zhuǎn)座子插入對(duì)等位基因特異性表達(dá)的調(diào)控機(jī)制卻知之甚少。

圖為蘋果轉(zhuǎn)座子插入調(diào)控等位基因特異性表達(dá)。中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所供圖

該研究以“嘎拉”蘋果花培純系為試驗(yàn)材料,完成了全基因組測(cè)序和組裝;并進(jìn)一步利用“皇家嘎拉”花和果實(shí)的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),在全基因組范圍內(nèi)鑒定到2091個(gè)等位基因特異性表達(dá)。將存在轉(zhuǎn)座子的等位基因特異性表達(dá)基因序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),蘋果花青素生物合成轉(zhuǎn)錄因子MYB110a和MYB10上游區(qū)域均存在轉(zhuǎn)座子插入。通過對(duì)231份蘋果種質(zhì)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),兩個(gè)MYB基因上游區(qū)域的轉(zhuǎn)座子插入與等位基因特異性表達(dá)和花青苷積累呈正相關(guān),揭示了蘋果花色演化的基礎(chǔ)。

該研究不僅從全基因組層面闡釋了轉(zhuǎn)座子在調(diào)控等位基因特異性表達(dá)方面的重要作用,同時(shí)也為在全基因組范圍內(nèi)快速鑒定植物中等位基因特異性表達(dá)基因及其調(diào)控元件提供了新方法。

上一篇:
下一篇:

關(guān)鍵詞: 等位基因

“如果發(fā)現(xiàn)本網(wǎng)站發(fā)布的資訊影響到您的版權(quán),可以聯(lián)系本站!同時(shí)歡迎來本站投稿!

虛擬

未來