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掌握DNA分子的“車流速度”——單分子操作實現(xiàn)近乎完美控制|總編輯圈點|環(huán)球頭條

2023-06-20 05:20:52 科技日報


(資料圖)

通過首次將納米孔技術(shù)與掃描離子電導(dǎo)顯微鏡相結(jié)合,研究人員實現(xiàn)了對單個分子操作的近乎完美的控制。圖片來源:EPFL

科技日報記者?張夢然

瑞士洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院(EPFL)研究人員多年來致力于改進納米孔技術(shù),該技術(shù)可讓DNA分子通過膜上的小孔以測量離子電流,研究人員則可以通過分析核苷酸在電流通過時的擾動情況,來確定DNA的核苷酸序列。該研究19日發(fā)表在《自然·納米技術(shù)》上。

分子的快速運動使得對其實現(xiàn)高精度分析具有挑戰(zhàn)性。EPFL團隊成員稱,將納米孔的靈敏度與掃描離子電導(dǎo)顯微鏡(SICM)的精度相結(jié)合,他們就能鎖定特定的分子的位置并控制它們移動的速度。這種精巧的控制填補了該領(lǐng)域的一個巨大空白。

團隊使用先進的掃描離子電導(dǎo)光譜(SICS)實現(xiàn)了這種控制。SICM利用流經(jīng)探針尖端的離子電流的變化,可生成高分辨率3D圖像數(shù)據(jù)。而其創(chuàng)新技術(shù)減緩了分子通過的速度,允許對同一分子甚至分子上的不同位置進行數(shù)千次連續(xù)讀數(shù)。

研究人員用汽車類比這種方法舉例說明:“想象一下,當(dāng)你站在窗前看著汽車來回行駛。如果汽車減速并反復(fù)駛過,讀取他們的牌照會容易得多。我們現(xiàn)在可決定是要每次測量1000種不同的分子,還是測量同一分子1000次,這代表了該領(lǐng)域真正的范式轉(zhuǎn)變。”

這一成果不但可顯著改善診斷和測序領(lǐng)域,還可應(yīng)用于DNA以外的分子,推進蛋白質(zhì)組學(xué)研究。例如肽的蛋白質(zhì)構(gòu)建塊,由于肽“牌照”由20個“字符”(氨基酸)組成,而不是DNA的4個核苷酸,因此尋找肽測序解決方案一直是一項重大挑戰(zhàn),但這種新控制方法會為肽測序開辟一條更容易的道路。

總編輯圈點

在DNA測序這一領(lǐng)域,納米孔技術(shù)已經(jīng)得到了廣泛應(yīng)用。當(dāng)DNA分子通過納米尺寸的空隙時,因為堿基的不同,產(chǎn)生相應(yīng)的電流變化,識別出這種變化,就能反推堿基還原DNA序列。本文介紹的研究中,團隊在應(yīng)用納米孔技術(shù)的基礎(chǔ)上,還實現(xiàn)了對分子通過速度的控制,掃描離子電導(dǎo)顯微鏡可高分辨率非接觸式研究活細胞表面形貌。研究人員用車流作比,讓汽車減速并反復(fù)通過,對車牌信息的辨識就會更為容易和全面。更精巧的控制,誕生了更多的測量解決方案。

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