近日，深圳市仙湖植物園的研究團隊與合作者使用轉錄組數據首次對苔類植物目級系統框架進行了重建，得到了高支持的系統發育樹，對苔類植物的系統分類和演化研究具有重要意義。相關成果以在線形式發表于國際著名期刊《Annals of Botany》上。
苔類(liverworts)是植物界的一個門，屬于苔蘚植物三個主要分支(苔、蘚、角苔)之一，其起源歷史可追溯至4億年前。作為一個古老的植物類群，苔類植物多樣性卻非常豐富，其深層次系統演化關系尚有很大爭議。
近年來，隨著高通量測序技術的發展，植物系統發育基因組學獲得了快速的發展，轉錄組數據被廣泛應用于植物系統發育基因組學中。研究人員取樣了55個苔類的轉錄組數據，覆蓋苔類15個目中的14個目，構建了1480個單拷貝核基因矩陣，首次對苔類目級系統框架進行了重建，得到了高支持的系統發育樹。
雖然苔類骨架系統關系獲得了高支持，其深層系統關系在單個核基因之間依然存在廣泛的沖突。此外，細胞器基因組數據與核基因組數據之間也存在沖突信號，暗示了苔類植物在演化過程中可能存在古老的雜交事件，其基因演化過程中存在不完全譜系分選的現象。苔類是陸地植物中少有的在其深層演化中沒有發生全基因組復制的大分支，此現象產生的原因及其背后的意義值得進一步的探究。
該論文第一作者為深圳市仙湖植物園南亞熱帶植物多樣性重點實驗室董珊珊副研究員，通訊作者為劉陽研究員。仙湖植物園張力研究員、深圳華大生命科學研究院聯合培養研究生余進博士、美國康涅狄克大學Bernard Goffinet教授共同完成了該項工作。該研究得到深圳市城市管理和執法局科研專項基金的支持。(記者 文燦 通訊員 張力)
